Predrag Radivojac: шукати на сайті Z-Library

Amrita Mohan, Christopher J. Oldfield, Predrag Radivojac, Vladimir Vacic, Marc S. Cortese, A. Keith Dunker, Vladimir N. Uversky

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 412 KB

english, 2010

Analysis of Molecular Recognition Features (MoRFs)

Журнал:

Journal of Molecular Biology

Рік:

2006

Мова:

english

Файл:

PDF, 754 KB

english, 2006

Bioinformatics Curriculum Guidelines: Toward a Definition of Core Competencies

Welch, Lonnie, Lewitter, Fran, Schwartz, Russell, Brooksbank, Cath, Radivojac, Predrag, Gaeta, Bruno, Schneider, Maria Victoria

Журнал:

Sourav Roy, Santiago Schnell, Predrag Radivojac

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.59 MB

english, 2014

Prediction of functional regulatory SNPs in monogenic and complex disease

Yiqiang Zhao, Wyatt T. Clark, Matthew Mort, David N. Cooper, Predrag Radivojac, Sean D. Mooney

Журнал:

Human Mutation

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 267 KB

english, 2011

Unraveling the nature of the segmentation clock: Intrinsic disorder of clock proteins and their interaction map

Журнал:

Computational Biology and Chemistry

Рік:

2006

Мова:

english

Файл:

PDF, 310 KB

english, 2006

HIP2: An online database of human plasma proteins from healthy individuals

Sudipto Saha, Scott H Harrison, Changyu Shen, Haixu Tang, Predrag Radivojac, Randy J Arnold, Xiang Zhang, Jake Yue Chen

Журнал:

BMC Medical Genomics

Рік:

2008

Мова:

english

Файл:

PDF, 901 KB

english, 2008

Predicting intrinsic disorder from amino acid sequence

Zoran Obradovic, Kang Peng, Slobodan Vucetic, Predrag Radivojac, Celeste J. Brown, A. Keith Dunker

Журнал:

Zoran Obradovic, Kang Peng, Slobodan Vucetic, Predrag Radivojac, A. Keith Dunker

Рік:

2003

Мова:

english

Файл:

PDF, 347 KB

english, 2003

Exploiting heterogeneous sequence properties improves prediction of protein disorder

Журнал:

Predrag Radivojac, Slobodan Vucetic, Timothy R. O'Connor, Vladimir N. Uversky, Zoran Obradovic, A. Keith Dunker

Рік:

2005

Мова:

english

Файл:

PDF, 470 KB

english, 2005

Calmodulin signaling: Analysis and prediction of a disorder-dependent molecular recognition

Журнал:

Рік:

2006

Мова:

english

Файл:

PDF, 332 KB

english, 2006

An integrated approach to inferring gene–disease associations in humans

Predrag Radivojac, Kang Peng, Wyatt T. Clark, Brandon J. Peters, Amrita Mohan, Sean M. Boyle, Sean D. Mooney

Журнал:

Wyatt T. Clark, Predrag Radivojac

Рік:

2008

Мова:

english

Файл:

PDF, 213 KB

english, 2008

Analysis of protein function and its prediction from amino acid sequence

Журнал:

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.54 MB

english, 2011

Improved amino acid flexibility parameters

David K. Smith, Predrag Radivojac, Zoran Obradovic, A. Keith Dunker, Guang Zhu

Журнал:

Рік:

2003

Мова:

english

Файл:

PDF, 396 KB

english, 2003

Protein flexibility and intrinsic disorder

Predrag Radivojac, Zoran Obradovic, David K. Smith, Guang Zhu, Slobodan Vucetic, Celeste J. Brown, J. David Lawson, A. Keith Dunker

Журнал:

Eunseog Youn, Brandon Peters, Predrag Radivojac, Sean D. Mooney

Рік:

2004

Мова:

english

Файл:

PDF, 140 KB

english, 2004

Evaluation of features for catalytic residue prediction in novel folds

Журнал:

The American Journal of Human Genetics

Рік:

2007

Мова:

english

Файл:

PDF, 608 KB

english, 2007

Comparing Phylogeny and the Predicted Pathogenicity of Protein Variations Reveals Equal Purifying Selection across the Global Human mtDNA Diversity

Luísa Pereira, Pedro Soares, Predrag Radivojac, Biao Li, David C. Samuels

Журнал:

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 418 KB

english, 2011

Investigation of VUV photodissociation propensities using peptide libraries

Xiaohui Liu, Yong Fuga Li, Brian C. Bohrer, Randy J. Arnold, Predrag Radivojac, Haixu Tang, James P. Reilly

Журнал:

International Journal of Mass Spectrometry

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.64 MB

english, 2011

Classification and knowledge discovery in protein databases

Predrag Radivojac, Nitesh V. Chawla, A. Keith Dunker, Zoran Obradovic

Журнал:

Journal of Biomedical Informatics

Рік:

2004

Мова:

english

Файл:

PDF, 477 KB

english, 2004

Analysis of AML genes in dysregulated molecular networks

Eunjung Lee, Hyunchul Jung, Predrag Radivojac, Jong-Won Kim, Doheon Lee

Журнал:

Рік:

2009

Мова:

english

Файл:

PDF, 991 KB

english, 2009

Structure-based kernels for the prediction of catalytic residues and their involvement in human inherited disease

Fuxiao Xin, Steven Myers, Yong Fuga Li, David N Cooper, Sean D Mooney, Predrag Radivojac

Журнал:

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 154 KB

english, 2010

Length-dependent prediction of protein intrinsic disorder

Kang Peng, Predrag Radivojac, Slobodan Vucetic, A Keith Dunker, Zoran Obradovic

Журнал:

Nussinov, Ruth, Tsai, Chung-Jung, Xin, Fuxiao, Radivojac, Predrag

Рік:

2006

Мова:

english

Файл:

PDF, 523 KB

english, 2006

Allosteric post-translational modification codes

Журнал:

Trends in Biochemical Sciences

Рік:

2012

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.09 MB

english, 2012

Intrinsic Disorder and Functional Proteomics

Radivojac, Predrag, Iakoucheva, Lilia M., Oldfield, Christopher J., Obradovic, Zoran, Uversky, Vladimir N., Dunker, A. Keith

Журнал:

Biophysical Journal

Рік:

2007

Мова:

english

Файл:

PDF, 478 KB

english, 2007

A large-scale evaluation of computational protein function prediction

Radivojac, Predrag, Clark, Wyatt T, Oron, Tal Ronnen, Schnoes, Alexandra M, Wittkop, Tobias, Sokolov, Artem, Graim, Kiley, Funk, Christopher, Verspoor, Karin, Ben-Hur, Asa, Pandey, Gaurav, Yunes, Jeff

Журнал:

Nature Methods

Рік:

2013

Мова:

english

Файл:

PDF, 624 KB

english, 2013

Computational approaches to protein inference in shotgun proteomics

Yong Fuga Li, Predrag Radivojac

Журнал:

Alaa Abi-Haidar, Jasleen Kaur, Ana Maguitman, Predrag Radivojac…

Рік:

2012

Мова:

english

Файл:

PDF, 884 KB

english, 2012

Uncovering protein interaction in abstracts and text using a novel linear model and word proximity networks

Журнал:

Genome Biology

Рік:

2008

Мова:

english

Файл:

PDF, 5.19 MB

english, 2008

Intrinsic disorder in pathogenic and non-pathogenic microbes: discovering and analyzing the unfoldomes of early-branching eukaryotes

Mohan, Amrita, Sullivan Jr, William J., Radivojac, Predrag, Dunker, A. Keith, Uversky, Vladimir N.

Журнал:

Molecular BioSystems

Рік:

2008

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.22 MB

english, 2008

Analysis of Features from Protein-protein Hetero-complex Structures to Predict Protein Interaction Interfaces Using Machine Learning

Bagchi, Angshuman, Mort, Matthew, Li, Biao, Xin, Fuxiao, Carlise, Carson, Oron, Tal, Powell, Corey, Youn, Eunseog, Radivojac, Predrag, Cooper, David N., Mooney, Sean D.

Журнал:

Procedia Technology

Рік:

2013

Мова:

english

Файл:

PDF, 215 KB

english, 2013

Intrinsic size parameters for palmitoylated and carboxyamidomethylated peptides

Li, Zhiyu, Dilger, Jonathan M., Pejaver, Vikas, Smiley, David, Arnold, Randy J., Mooney, Sean D., Mukhopadhyay, Suchetana, Radivojac, Predrag, Clemmer, David E.

Журнал:

International Journal of Mass Spectrometry

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.06 MB

english, 2014

The structural and functional signatures of proteins that undergo multiple events of post-translational modification

Pejaver, Vikas, Hsu, Wei-Lun, Xin, Fuxiao, Dunker, A. Keith, Uversky, Vladimir N., Radivojac, Predrag

Журнал:

Bohrer, Brian C., Li, Yong Fuga, Reilly, James P., Clemmer, David E., DiMarchi, Richard D., Radivojac, Predrag, Tang, Haixu, Arnold, Randy J.

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.68 MB

english, 2014

Combinatorial Libraries of Synthetic Peptides as a Model for Shotgun Proteomics

Журнал:

Analytical Chemistry

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 3.79 MB

english, 2010

The Importance of Peptide Detectability for Protein Identification, Quantification, and Experiment Design in MS/MS Proteomics

Li, Yong Fuga, Arnold, Randy J., Tang, Haixu, Radivojac, Predrag

Журнал:

Journal of Proteome Research

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.25 MB

english, 2010

On the Accuracy and Limits of Peptide Fragmentation Spectrum Prediction

Li, Sujun, Arnold, Randy J., Tang, Haixu, Radivojac, Predrag

Журнал:

Analytical Chemistry

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.93 MB

english, 2011

Characterization of Molecular Recognition Features, MoRFs, and Their Binding Partners

Vacic, Vladimir, Oldfield, Christopher J., Mohan, Amrita, Radivojac, Predrag, Cortese, Marc S., Uversky, Vladimir N., Dunker, A. Keith

Журнал:

Journal of Proteome Research

Рік:

2007

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.15 MB

english, 2007

Graphlet Kernels for Prediction of Functional Residues in Protein Structures

Vacic, Vladimir, Iakoucheva, Lilia M., Lonardi, Stefano, Radivojac, Predrag

Журнал:

Journal of Computational Biology

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 15.25 MB

english, 2010

A Bayesian Approach to Protein Inference Problem in Shotgun Proteomics

Li, Yong Fuga, Arnold, Randy J., Li, Yixue, Radivojac, Predrag, Sheng, Quanhu, Tang, Haixu

Журнал:

Journal of Computational Biology

Рік:

2009

Мова:

english

Файл:

PDF, 225 KB

english, 2009

On the Split Personality of Penultimate Proline

Glover, Matthew S., Shi, Liuqing, Fuller, Daniel R., Arnold, Randy J., Radivojac, Predrag, Clemmer, David E.

Журнал:

Journal of the American Society for Mass Spectrometry

Рік:

2015

Мова:

english

Файл:

PDF, 926 KB

english, 2015

OPTIMIZING LONG INTRINSIC DISORDER PREDICTORS WITH PROTEIN EVOLUTIONARY INFORMATION

PENG, KANG, VUCETIC, SLOBODAN, RADIVOJAC, PREDRAG, BROWN, CELESTE J., DUNKER, A. KEITH, OBRADOVIC, ZORAN

Журнал:

Journal of Bioinformatics and Computational Biology

Рік:

2005

Мова:

english

Файл:

PDF, 354 KB

english, 2005

Extending the coverage of spectral libraries: A neighbor-based approach to predicting intensities of peptide fragmentation spectra

Ji, Chao, Arnold, Randy J., Sokoloski, Kevin J., Hardy, Richard W., Tang, Haixu, Radivojac, Predrag

Журнал:

PROTEOMICS

Рік:

2013

Мова:

english

Файл:

PDF, 755 KB

english, 2013

Generalized graphlet kernels for probabilistic inference in sparse graphs

LUGO-MARTINEZ, JOSE, RADIVOJAC, PREDRAG

Журнал:

Network Science

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 742 KB

english, 2014

MutPred Splice: machine learning-based prediction of exonic variants that disrupt splicing

Mort, Matthew, Sterne-Weiler, Timothy, Li, Biao, Ball, Edward V, Cooper, David N, Radivojac, Predrag, Sanford, Jeremy R, Mooney, Sean D

Журнал:

Genome Biology

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.33 MB

english, 2014

Testing the Ortholog Conjecture with Comparative Functional Genomic Data from Mammals

Nehrt, Nathan L., Clark, Wyatt T., Radivojac, Predrag, Hahn, Matthew W., Rzhetsky, Andrey

Журнал:

Duan, Guangyou, Walther, Dirk, Radivojac, Predrag

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 516 KB

english, 2011

The Roles of Post-translational Modifications in the Context of Protein Interaction Networks

Журнал:

Faure, Guilhem, Callebaut, Isabelle, Radivojac, Predrag

Рік:

2015

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.25 MB

english, 2015

Comprehensive Repertoire of Foldable Regions within Whole Genomes

Журнал:

Mohan, Amrita, Uversky, Vladimir N., Radivojac, Predrag, Nussinov, Ruth

Рік:

2013

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.12 MB

english, 2013

Influence of Sequence Changes and Environment on Intrinsically Disordered Proteins

Журнал:

Friedberg, Iddo, Wass, Mark N., Mooney, Sean D., Radivojac, Predrag

Рік:

2009

Мова:

english

Файл:

PDF, 479 KB

english, 2009

Ten Simple Rules for a Community Computational Challenge

Журнал:

Kosti, Idit, Radivojac, Predrag, Mandel-Gutfreund, Yael, Teichmann, Sarah A.

Рік:

2015

Мова:

english

Файл:

PDF, 90 KB

english, 2015

An Integrated Regulatory Network Reveals Pervasive Cross-Regulation among Transcription and Splicing Factors

Журнал:

Haynes, Chad, Oldfield, Christopher J., Ji, Fei, Klitgord, Niels, Cusick, Michael E., Radivojac, Predrag, Uversky, Vladimir N., Vidal, Marc, Iakoucheva, Lilia M.

Рік:

2012

Мова:

english

Файл:

PDF, 724 KB

english, 2012

Intrinsic Disorder Is a Common Feature of Hub Proteins from Four Eukaryotic Interactomes

Журнал:

Macossay-Castillo, Mauricio, Kosol, Simone, Tompa, Peter, Pancsa, Rita, Radivojac, Predrag

Рік:

2006

Мова:

english

Файл:

PDF, 528 KB

english, 2006

Synonymous Constraint Elements Show a Tendency to Encode Intrinsically Disordered Protein Segments

Журнал:

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.58 MB

english, 2014

ISCB Computational Biology Wikipedia Competition

Bateman, Alex, Kelso, Janet, Mietchen, Daniel, Macintyre, Geoff, Di Domenico, Tomás, Abeel, Thomas, Logan, Darren W., Radivojac, Predrag, Rost, Burkhard

Журнал:

Youngs, Noah, Penfold-Brown, Duncan, Bonneau, Richard, Shasha, Dennis, Radivojac, Predrag

Рік:

2013

Мова:

english

Файл:

PDF, 237 KB

english, 2013

Negative Example Selection for Protein Function Prediction: The NoGO Database

Журнал: